Mercury in the structure of Structure Of The Mercury-Bound Form of Merp, The Periplasmic Protein From the Bacterial Mercury Detoxification System, uc(Nmr), 20 Structures (pdb 1afj)

The binding sites of Mercury atom in the structure of Structure Of The Mercury-Bound Form of Merp, The Periplasmic Protein From the Bacterial Mercury Detoxification System, uc(Nmr), 20 Structures (pdb code 1afj). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Mercury atom. The 1afj structure was solved by R.A.STEELE, S.J.OPELLA, with NMR in Solution technique. Mercury Binding Sites: Mercury binding site 1 out of 1 in 1afj Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Mercury in the PDB 1afj. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Mercury atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Met12, A: Thr13, A: Cys14, A: Ala15, A: Ala16, A: Cys17, A: Pro18, A: Ala1, A: Gly30, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Met12, A: Cys14, A: Ala15, A: Ala16, A: Cys17, A: Pro18, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Phe47, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Thr13, A: Cys14, A: Ala15, A: Ala16, A: Cys17, A: Pro18, A: Ala1, A: Phe47, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Met12, A: Cys14, A: Ala15, A: Ala16, A: Cys17, A: Pro18, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ser53, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Phe47, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, A: Ala1, A: Asp48, A: Asp49, A: Thr50, A: Lys51, A: Ala52, conact list: Atom Atom Distance (A) Hg HB2 A:Met12 3.95 Hg CB A:Met12 4.94 Hg H A:Thr13 4.26 Hg O A:Cys14 4.11 Hg HB2 A:Cys14 4.27 Hg N A:Cys14 4.27 Hg CB A:Cys14 3.39 Hg HB3 A:Cys14 3.25 Hg SG A:Cys14 2.32 Hg H A:Cys14 4.11 Hg C A:Cys14 4.07 Hg CA A:Cys14 4.14 Hg O A:Ala15 4.94 Hg N A:Ala15 4.59 Hg H A:Ala15 4.92 Hg C A:Ala15 4.49 Hg O A:Ala16 4.83 Hg HB2 A:Ala16 2.47 Hg N A:Ala16 3.86 Hg CB A:Ala16 3.07 Hg HB3 A:Ala16 3.99 Hg HA A:Ala16 4.82 Hg H A:Ala16 3.88 Hg C A:Ala16 3.76 Hg CA A:Ala16 3.78 Hg HB1 A:Ala16 2.83 Hg HB2 A:Cys17 3.34 Hg N A:Cys17 3.01 Hg CB A:Cys17 3.38 Hg HB3 A:Cys17 4.33 Hg HA A:Cys17 4.48 Hg SG A:Cys17 2.33 Hg H A:Cys17 2.24 Hg CA A:Cys17 3.87 Hg CD A:Pro18 4.10 Hg HD2 A:Pro18 3.72 Hg HD3 A:Pro18 3.50 Hg HB2 A:Met12 3.95 Hg CB A:Met12 4.94 Hg O A:Cys14 4.11 Hg HB2 A:Cys14 4.27 Hg N A:Cys14 4.27 Hg CB A:Cys14 3.39 Hg HB3 A:Cys14 3.25 Hg SG A:Cys14 2.32 Hg H A:Cys14 4.11 Hg C A:Cys14 4.07 Hg CA A:Cys14 4.14 Hg O A:Ala15 4.94 Hg N A:Ala15 4.59 Hg H A:Ala15 4.92 Hg C A:Ala15 4.49 Hg O A:Ala16 4.83 Hg HB2 A:Ala16 2.47 Hg N A:Ala16 3.86 Hg CB A:Ala16 3.07 Hg HB3 A:Ala16 3.99 Hg HA A:Ala16 4.82 Hg H A:Ala16 3.88 Hg C A:Ala16 3.76 Hg CA A:Ala16 3.78 Hg HB1 A:Ala16 2.83 Hg HB2 A:Cys17 3.34 Hg N A:Cys17 3.01 Hg CB A:Cys17 3.38 Hg HB3 A:Cys17 4.33 Hg HA A:Cys17 4.48 Hg SG A:Cys17 2.33 Hg H A:Cys17 2.24 Hg CA A:Cys17 3.87 Hg CD A:Pro18 4.10 Hg HD2 A:Pro18 3.72 Hg HD3 A:Pro18 3.50 Hg H A:Thr13 4.26 Hg O A:Cys14 4.11 Hg HB2 A:Cys14 4.27 Hg N A:Cys14 4.27 Hg CB A:Cys14 3.39 Hg HB3 A:Cys14 3.25 Hg SG A:Cys14 2.32 Hg H A:Cys14 4.11 Hg C A:Cys14 4.07 Hg CA A:Cys14 4.14 Hg O A:Ala15 4.94 Hg N A:Ala15 4.59 Hg H A:Ala15 4.92 Hg C A:Ala15 4.49 Hg O A:Ala16 4.83 Hg HB2 A:Ala16 2.47 Hg N A:Ala16 3.86 Hg CB A:Ala16 3.07 Hg HB3 A:Ala16 3.99 Hg HA A:Ala16 4.82 Hg H A:Ala16 3.88 Hg C A:Ala16 3.76 Hg CA A:Ala16 3.78 Hg HB1 A:Ala16 2.83 Hg HB2 A:Cys17 3.34 Hg N A:Cys17 3.01 Hg CB A:Cys17 3.38 Hg HB3 A:Cys17 4.33 Hg HA A:Cys17 4.48 Hg SG A:Cys17 2.33 Hg H A:Cys17 2.24 Hg CA A:Cys17 3.87 Hg CD A:Pro18 4.10 Hg HD2 A:Pro18 3.72 Hg HD3 A:Pro18 3.50 Hg HB2 A:Met12 3.95 Hg CB A:Met12 4.94 Hg O A:Cys14 4.11 Hg HB2 A:Cys14 4.27 Hg N A:Cys14 4.27 Hg CB A:Cys14 3.39 Hg HB3 A:Cys14 3.25 Hg SG A:Cys14 2.32 Hg H A:Cys14 4.11 Hg C A:Cys14 4.07 Hg CA A:Cys14 4.14 Hg O A:Ala15 4.94 Hg N A:Ala15 4.59 Hg H A:Ala15 4.92 Hg C A:Ala15 4.49 Hg O A:Ala16 4.83 Hg HB2 A:Ala16 2.47 Hg N A:Ala16 3.86 Hg CB A:Ala16 3.07 Hg HB3 A:Ala16 3.99 Hg HA A:Ala16 4.82 Hg H A:Ala16 3.88 Hg C A:Ala16 3.76 Hg CA A:Ala16 3.78 Hg HB1 A:Ala16 2.83 Hg HB2 A:Cys17 3.34 Hg N A:Cys17 3.01 Hg CB A:Cys17 3.38 Hg HB3 A:Cys17 4.33 Hg HA A:Cys17 4.48 Hg SG A:Cys17 2.33 Hg H A:Cys17 2.24 Hg CA A:Cys17 3.87 Hg CD A:Pro18 4.10 Hg HD2 A:Pro18 3.72 Hg HD3 A:Pro18 3.50 interactive model: